La R9 está propulsada por el galardonado motor Yamaha CP3 de 890 cc con refrigeración líquida, tres cilindros, DOHC, 4 válvulas por cilindro e inyección de combustible. Con unas cotas de diámetro x carrera de 78 mm x 62 mm y 11,5: de relación de compresión, proporciona un par excelente y una gran potencia, lo que combinado con el control preciso que ofrece el acelerador controlado por chip Yamaha (YCCT), ofrece un rendimiento óptimo tanto en circuito como en carretera. La relación de transmisión final, el reglaje del encendido y el mapeado de la inyección están optimizados para un rendimiento superdeportivo.
En el chasis de aluminio fundido por gravedad tipo Deltabox, desarrollado específicamente para la R9, se ha ajustado la rigidez para obtener un rendimiento deportivo tanto a cargas bajas como altas. El peso independiente del chasis de 9,7 kg lo convierte en el chasis más ligero jamás utilizado para un modelo Supersport de Yamaha. Este ligero chasis permite un peso total de la R9 de sólo 195 kg, lo que se traduce en una relación peso-potencia óptima.
La R9 es una de las motocicletas Yamaha más eficientes aerodinámicamente hasta la fecha, esto se consigue gracias a una combinación del diseño del carenado delantero desarrollado mediante exhaustivas pruebas en el túnel de viento. Los alerones de carga aerodinámica situados justo debajo de la óptica delantera reducen la elevación de la rueda delantera y mejoran el contacto con el asfalto. Los alerones por sí solos reducen la elevación de la rueda delantera entre un 6 y un 7 % en línea recta, y cuando se combinan con el alerón delantero situado bajo la toma de admisión M, este efecto aumenta hasta aproximadamente un 10 % en las curvas.
La R9 incorpora ligeras y rígidas pinzas monobloque Brembo Stylema derivadas de la competición, diseñadas para proporcionar un mejor control y estabilidad en la frenada. Los latiguillos de freno de acero inoxidable y los grandes discos delanteros de 320 mm ofrecen una excelente consistencia y una gran sensación de control, especialmente en frenadas fuertes. La bomba de freno radial Brembo incorpora un pistón que se mueve en dirección paralela a la maneta de freno, aplicando presión de forma lineal a medida que el piloto presiona la misma, lo que se traduce en una refinada sensación de control.
La nueva horquilla delantera invertida KYB de 43 mm se ha rediseñado por completo y ahora incorpora reguladores individuales para la amortiguación de extensión y compresión en las botellas izquierda y derecha de la horquilla. Cada una puede ajustarse individualmente, con la botella derecha para la amortiguación de extensión y la izquierda para la compresión, tanto a alta como a baja velocidad. El amortiguador trasero es ajustable en precarga, amortiguación de extensión, compresión y altura de pilotaje. La nueva disposición contribuye a una amortiguación de gran precisión que ofrece así una mayor respuesta de la superficie del circuito o de la carretera.
A los tres modos de conducción integrados: "Sport", "Street" y "Rain", con configuraciones de fábrica de diferentes niveles para adaptarse a condiciones variadas, se ha añadido la opción de dos modos personalizables preconfigurados y cuatro modos Track.
| Tipo de motor | 4 tiempos, Refrigerado por líquido, DOHC, 4 válvulas, 3 cilindros |
| Cilindrada | 890 cc |
| Diámetro x carrera | 78,0 mm × 62,1 mm |
| Relación de compresión | 11,5:1 |
| Sistema de lubricación | Cárter húmedo |
| Tipo de embrague | Húmedo;Multidisco |
| Sistema de encendido | TCI |
| Sistema de arranque | Eléctrico |
| Sistema de transmisión | Toma constante;6 velocidades |
| Transmisión final | Cadena |
| Carburador | Inyección de combustible |
| Potencia máxima | 87,5 kW (119,0 CV) a 10.000 rpm |
| Par máximo | 93 Nm (9,5 kgf.m) / 7000rpm |
| Versión de potencia limitada | 35,0 kW (47,6PS) @ 6.000 rpm |
| CO2 emisión | 116 g/km |
| Chasis | Diamante |
| Sistema de suspensión delantera | horquilla telescópica, Ø 43 mm) |
| Recorrido delantero | 120 mm |
| Sistema de suspensión trasera | Brazo oscilante (Suspensión tipo eslabón) |
| Recorrido trasero | 118 mm |
| Freno delantero | Freno hidráulico de doble disco, Ø 320 mm |
| Freno trasero | Un disco hidráulico de Ø 220 mm |
| Neumático delantero | 120/70ZR17M/C (58W) sin cámara |
| Neumático trasero | 180/55ZR17M/C (73W) sin cámara |
| Ángulo de avance del pivote | 22°35′ |
| Avance del pivote | 94 mm |
| Longitud total | 2070 mm |
| Anchura total | 705 mm |
| Altura total | 1180 mm |
| Altura del asiento | 830 mm |
| Distancia entre ejes | 1420 mm |
| Distancia mínima al suelo | 140 mm |
| Peso (incluidos depósito de aceite y depósito de combustible llenos) | 195 kg |
| Capacidad del depósito de combustible | 14 L |
| Capacidad del depósito de aceite | 3,50 L |
